À Boston, quand un homme rentre dasn une salle de réunion, il se comporte bizarrement avant de perdre connaissance. Ses veines éclatent éclaboussant la pièce. 
Un livreur cycliste, Mike, fait une livraison à Vitrus Petrol. Alors qu’il prend l’ascenseur, un hollandais chauve monte au même étage. Ils font la conversation et Mike remarque que l’homme transpire et commence à saigner du nez. Le hollandais passe devant le bureau de la réceptionniste et continue d’avancer, ignorant la jeune femme. Il s’effondre par terre et Mike essaye de lui faire les gestes sde premier secours. Le hollandais meurt malgré tous ses efforts, mais ses veines se mettent soudainement à enfler et l’homme crache du sang de sa bouche.
Astrid a perdu Walter dans le centre de la Science pour Enfants de Boston. Elle finit par le retrouver, donnant une petite conférence à un groupe d’enfants sur le voyage du Victoria, le vaisseau de Magellan. Seuls dix-huit hommes ont survécu et Walter explique aux enfants que les enquêtes portent des risques, mais qu’au moins si vous mourez votre famille pourrait être en sureté. Le professeur fait révoquer l’accès au centre scientifique de Walter, alors qu’Astrid emmène Walter avec elle. Walter se plaint de son sort mais est interrompu quand Olivia appelle pour les convoquer à Vitrus Petrol.
Olivia et Peter arrivent sur la scène les premiers et parlent avec le détective Kassel. Il les informe que l’homme mort est Radian Vandenkemp, mais qu’ils n’ont aucune idée de pourquoi il était là. Olivia parle à la réceptionniste, Linda, qui confirme que Vandenkemp n’avait rendez-vous avec personne. Broyles arrive en bas du bâtiment et appelle pour les avertir de sa présence, pendant qu’Olivia parle avec Vincent Ames, le représentant de Geotechnical Engineering. Ames veut savoir s’ils auront le droit de partir, mais Olivia lui répond qu’ils doivent encore confirmer qu’il n’y aucun danger. Olivia demande à Linda de voir Mark, mais ils découvrent qu’il est parti dans les toilettes. Alors qu’il lave sa figure, il découvre qu’il saigne du nez.
Walter et Astrid arrivent et rejoignent Broyles. Pendant qu’ils se préparent à entrer, Walter suggère plusieurs théories qui expliqueraient l’explosion sanglante de Vanderkemp. Alors qu’ils arrivent près de l’entrée, Mike s’approche également de la porte, mais de l’intérieur. Walter voit les veines du livreur commencer à enfler et verrouille rapidement la porte d’entrée alors que Mike essaye de sortir. Le livreur les fixe du regard un moment, puis crache du sang par la bouche et s’effondre. Peter arrive et Walter le fixe du regard. Il finit par dire à Broyles qu’ils doivent placer le bâtiment en quarantaine.
Une fois le bâtiment scellé, Walter appelle Peter et dit à son fils qu’il doit savoir pourquoi Vandenkemp était là. Pendant que des employés du Central for Disease Control [Centre de Contrôle des Infections] arrivent, Walter dit à Pater de faire attention, et insiste pour continuer ses recherches, ignorant les réassurances d’Astrid.
Olivia et Peter parlent de la mise en quarantaine et de la mort du livreur aux employés de Vitrus. Les gens paniquent, chacun se demandant s’il a été infecté. Le CDC arrête la ventilation pour limiter la propagation du virus, pendant qu’Olivia sépare les employés en deux groupes : ceux qui s’étaient trouvés près de Vandenkemp et les autres qui semblent ne pas être infectés.
Le directeur de terrain du CDC, Arnold McFadden arrive et fait évacuer toutes les personnes dans un périmètre de deux « pâtés de maisons » autour du bâtiment. Il commence à parler avec Broyles, mais Astrid leur dit que les hommes du CDC ont arrêté Walter pour être passé sous la ligne de sécurité. Broyles et McFadden vont enquêter et Walter explique qu’il essaye de trouver un remède. Il s’exprime brutalement envers McFadden et finit par s’excuser sur l’insistance de Broyles. Quand Walter explique qu’il doit ramener un échantillon son labo pour des analyses, Broyles convainc McFadden de lui assigner un agent, Hubert, pour accompagner Walter à Harvard.
A l’intérieur, Olivia parcourt les registres de rendez-vous sans succès. Peter lui demande si elle veut appeler sa sœur Rachel, mais Olivia l’ignore. Vérifiant les registres, elle découvre qu’Ames avait annulé deux rendez-vous ce matin-là, mais Ames est toujours dans le bâtiment. Un employé leur dit que Linda saigne du nez. Peter l’isole des autres et la fait s’allonger dans un bureau. Quand ils confirment que Linda n’était pas près de Vanderkemp quand il avait « explosé », ils suggèrent que c’est le livreur l’a infecté.
Olivia parle à Ames en privé et lui dit qu’elle sait. Il finit par avouer qu’il avait bien un rendez-vous de prévu avec Vanderkemp : l’homme avait des informations volées d’un compétiteur et était là pour leur apportait quelque chose provenant d’une réserve d’huile. Cependant, Ames avoue que Vanderkemp ne lui avait pas révélé ce qu’il allait vendre, ni à qui il l’avait volé. Olivia transmet l’information à Broyles, qui confirme que le hollandais était un consultant dans l’huile, du Moyen-Orient. Ni les passagers de son vol, ni les résidants de son hôtel n’avaient montré de signes d’infection.
Au labo, Walter essaye d’isoler la trace du virus tout en discutant des personnalités des virus. Il fait remarquer que les virus utilisent les humains pour survivre et se reproduire, et pourrait être placé s plus haut sur la chaine alimentaire. Hubert rapporte que la trace du virus n’avait pas survécu à la séparation, et Walter réalise que le virus ne se propage pas par l’air. Cependant, il dit à Hubert qu’ils ont besoin d’un meilleur échantillon.
Olivia explique finalement à Peter qu’elle n’a pas appelée sa sœur car Rachel s’était déjà beaucoup préoccupée de l’hospitalisation récente d’Olivia. Elle est confiante dans leur chance de survie, mais Peter observe qu’elle est toujours plus intéressée dans la protection des autres plutôt que dans le partage de ses propres émotions. Avant qu’Olivia ne puisse répondre, Linda quitte la pièce et traverse le couloir. Pete et Olivia se séparent pour la retrouver. Peter la trouve près du corps de Vanderkemp. Linda bondit vers lui, il glisse et tombe dans le sang de Vanderkemp. Avant de pouvoir se relever, Linda se jette par la fenêtre et tombe plusieurs étages plus bas, atterrissant sur une voiture. Du sang s’échappe de sa bouche, alors que les membres du CDC vaporisent un liquide anticontamination sur son corps.
En haut, Olivia trouve Peter et réalise qu’il a été contaminé. Il va dans les toilettes et essaye de se nettoyer pendant qu’Olivia appelle Broyles pour le mettre à jour. Peter essaye d’enlever le sang mais se rend compte qu’il en est recouvert. Se rendant compte qu’il n’a rien à perdre, il fouille le corps de Vanderkemp sous les protestations d’Olivia. Il trouve la clé d’une voiture de location. Il pense que Vandenkemp a laissé son matériel volé sur un site neutre, à l’intérieur de sa voiture de location.
Les agents du CDC trouvent la voiture de location dans un parking souterrain avoisinant. A l’intérieur du coffre se trouve une mallette contenant un échantillon de carotte. Walter arrive et dit à Broyles que le virus a utilisé Vanderkemp pour se propager. « Cela » avait conduit Vanderkemp à Vitrus, puis l’avait tué et l’avait obligé à libérer le sang, propageant le virus aux autres. Cependant, « cela » avait réalisé qu’il était piégé, et avait obligé Linda et Mike à essayait de sortir du bâtiment.
Le CDC analyse l’échantillon de la carotte d’huile et confirme qu’elle contient le virus. Ils déterminent que Vanderkemp a volé un échantillon de Solum Oil, mais n’avait pas réussi à respecter les précautions de sûreté. Walter examine le rapport d’échantillon et réalise qu’il provient de 10 miles sous terre, ce qui signifierait qu’il serait âgé de 75 000 ans, période à laquelle la plupart des mammifères furent éliminés. Il pense pouvoir produire un antidote, mais dit à Broyles et McFadden qu’ils doivent s’assurer du bien-être des gens à l’intérieur du bâtiment… dont Peter.
Walter, Astrid, et Hubert entre dans le bâtiment, portant des tenus de protection. Ils commencent à prendre des échantillons de sang aux employés pour tester la présence du virus. Alors qu’il les observe, Peter réalise que son nez saigne. Dehors, McFadden contacte le Département d’Etat et demande l’autorisation pour une éradication de Niveau Six. La procédure tuera toutes les personnes infectées pour empêcher la propagation du virus.
Walter vérifie les échantillons, en commençant par Ames. Il n’est pas infecté, et Walter et Astrid vérifie Olivia. Elle non plus n’est pas infectée. Quand ils prennent un échantillon de salive de Peter, il se débrouille pour échanger deux échantillons afin d’être sûr que son échantillon soit lui aussi négatif. Walter demande à Peter de mener le premier groupe d’employés non-infectés vers la sortie, mais les membres du CDC repère le saignement de nez de Peter et le force à rester à l’intérieur. Il essaye de forcer le passage, voulant sortir à tout prix, mais ils réussissent à le confiner à l’intérieur.
Olivia sort et voit Peter taper du poing sur la porte et la supplier de le laisser sortir. Walter et Astrid, toujours dans le bâtiment, apprennent que Peter est contaminé. Pendant ce temps, McFadden dit à Broyles que l’éradication complète est la seule solution. Quand Olivia leur dit que Peter et 11 employés sont contaminés et confiné dans le bâtiment, McFadden dit qu’ils n’ont pas d’autres choix que d’ordonner à l’armée de les tuer. Quand Olivia lui demande si c’est absolument nécessaire, McFadden une modélisation informatique démontrant que si seule une victime contaminée arrivait à s’échapper, le virus se propagerait en quelques jours seulement et recouvrirait le monde.
Walter finit ses tests et enlève sa combinaison, assurant Astrid que le virus n’est pas transmissible par l’air. Hubert fait sortir le reste des employés non-contaminés mais Walter refuse de partir et Astrid reste avec lui. Olivia les prévient de ce qui arrivera, mais Astrid dit qu’elle n’a pas à s’en faire. Walter se met à autopsier le corps de Vanderkemp afin de créer un antidote. Alors qu’il travaille, il insiste sur le fait que la création d’un antidote doit être possible puisque les homo sapiens avaient survécu au même virus 100 000 ans auparavant. Il commence à perdre le contrôle et insiste que Peter ne peut pas mourir à nouveau. Mais il se rend compte qu’il ne peut pas trouver d’antidote.
Astrid l’aide à se calmer, lui faisant observer que durant le voyage de Magellan, 18 hommes ont réussi à survivre malgré les dures conditions, et à l’encontre des fortes probabilités de mort. Walter remarque que les autres sont morts douloureusement de scorbut. Cependant, il conclut que quelque chose a du tuer le virus. Regardant Astrid, il prononce le mot « Cendres », mais explique qu’il fait référence à la cendre sulfurique. Il y a environ 75 000 ans, le Mont Toba était entré en éruption, provoquant la plus grande explosion de l’histoire de la Terre. Cela avait répandu de la cendre sulfurique à travers le monde, et le sulfure avait du tuer le virus. Walter dit à Astrid de fouiller le réfrigérateur et de faire l’inventaire de son contenu. Elle trouve quelques morceaux de raifort et Walter réalise que cela contient de grandes quantités de sulfure. Il en extrait le sulfure et l’injecte dans l’échantillon du virus. Ils confirment que cela a détruit le virus.
Astrid appelle Olivia pour lui parler de l’antidote. Elle transmet la nouvelle à McFadden, mais ils regardent les prisonniers infectés essayer de briser les fenêtres. Ils n’ont pas suffisamment de temps pour synthétiser le remède avant qu’ils ne réussissent à briser les fenêtres et ne puissent s’échapper. Broyles suggère d’injecter du gaz anesthésiant dans le bâtiment, mais McFadden lui fait remarquer qu’ils ont arrêté la ventilation un peu plus tôt et qu’il n’y a aucun moyen pour le propager dans tout le bâtiment. Olivia se prote volontaire pour entrer à l’intérieur et Broyles donne son accord à contrecœur.
Olivia entre dans le bâtiment par une sortie de secours mais Peter la repère sur les écrans de sécurité et part à sa poursuite. Elle va dans le local de contrôle de la ventilation mais Peter arrive et l’attaque. Enragé par le virus, Peter la désarme et lui dit de rester à terre, puis va dans l’ascenseur.
Dehors, McFadden prend le contrôle et ordonne aux soldats se trouvant à l’intérieur de tuer toutes les victimes. Pendant ce temps, Olivia allume la ventilation et ils commencent à faire passer du gaz anesthésiant dans le bâtiment. Les soldats s’approchent de l’ascenseur et s’apprêtent à tuer Peter… et découvre qu’il est inconscient suite à la libération du gaz.
Plus tard, Walter injecte l’antidote aux victimes. Peter se réveille et remercie les autres pour leur aide. Il s’excuse auprès d’Olivia pour l’avoir attaquée mais elle dit qu’il n’était pas lui-même. Peter avoue que c’était une bonne chose qu’elle soit là, sinon il n’aurait pas survécu.
Dehors, Astrid s’approche de Walter alors qu’il s’apprête à partir. Elle lui demande ce qu’il signifiait quand il a dit qu’il ne pourrait supporter de voir Peter mourir « à nouveau ». Walter lui dit que certaines choses ne doivent pas être dérangées et part.
Source: TVRage
